More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2728 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  48 
 
 		 203 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  47.94 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  47.94 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  47.94 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  48.69 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 210 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 206 aa  151  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  38.58 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 223 aa  104  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  40.67 
 
 		 218 aa  99  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  37.41 
 
 		 213 aa  87  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  34.01 
 
 		 210 aa  85.5  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 231 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  33.78 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  28.02 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  32.78 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  32.81 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 249 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  25.11 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  26.94 
 
 		 260 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  29.13 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 263 aa  58.2  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2594  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.971437  normal  0.0759549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  38.57 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 250 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 259 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3552  regulatory protein TetR  30.11 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 239 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 238 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 268 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 271 aa  52  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2574  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0758263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3861  regulatory protein TetR  37.21 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 232 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 278 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 268 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 243 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>