98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2574 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2574  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0758263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  49.77 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  40.3 
 
 		 190 aa  116  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  39.9 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0832  Tetracyclin repressor domain protein  28.8 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 258 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2719  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0631  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0559  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0181  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0664  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 268 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0585  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 250 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  44.07 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  53.49 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3750  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 250 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  25.3 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 283 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 249 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  28.24 
 
 		 260 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 246 aa  45.8  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 259 aa  45.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 216 aa  45.1  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 220 aa  44.7  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 232 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0152  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 239 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 343 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  28.42 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  26.25 
 
 		 262 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 272 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 255 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5480  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 285 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  25.39 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  21.14 
 
 		 238 aa  42.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  25.61 
 
 		 225 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  25.61 
 
 		 225 aa  42  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  25.61 
 
 		 225 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 224 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0775  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 185 aa  41.6  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00421215  hitchhiker  0.000834873 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 240 aa  42  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 228 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 224 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 220 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 242 aa  41.6  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 185 aa  41.6  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  24.53 
 
 		 238 aa  41.2  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 192 aa  41.2  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>