183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5480 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5480  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  400  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1322  TetR family transcriptional regulator  76.65 
 
 		 173 aa  262  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 232 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  37.76 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2177  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.191251  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 265 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  25.34 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 253 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 250 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 239 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 223 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  23.73 
 
 		 234 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 221 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 223 aa  51.2  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  26.44 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  25.13 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  25.13 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  25.13 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  28.36 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  29.03 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 268 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3861  regulatory protein TetR  23.24 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 239 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 342 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 271 aa  48.5  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  24.07 
 
 		 293 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 242 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 267 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 278 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 343 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 250 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 250 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 250 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0559  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 243 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0631  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0585  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4047  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 231 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0181  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0664  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 259 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>