200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0585 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0559  TetR family transcriptional regulator  99.53 
 
 		 215 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0585  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3750  TetR family transcriptional regulator  91.63 
 
 		 215 aa  377  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0631  TetR family transcriptional regulator  91.16 
 
 		 215 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0181  TetR family transcriptional regulator  90.7 
 
 		 215 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0664  TetR family transcriptional regulator  90.7 
 
 		 215 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2719  TetR family transcriptional regulator  86.19 
 
 		 223 aa  352  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  52.88 
 
 		 227 aa  224  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  51.44 
 
 		 223 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 259 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  27.73 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  43.01 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  39.6 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3353  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 257 aa  58.2  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3985  hypothetical protein  32.89 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  26.48 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  28.23 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  28.23 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  28.23 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 289 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2574  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0758263 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  29.3 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  28.57 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3334  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 195 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 258 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  28.12 
 
 		 247 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 253 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 229 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3109  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  30.71 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2177  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.191251  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  24.86 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  28.26 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3270  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8331  normal  0.0947304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 250 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 249 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 283 aa  48.5  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0775  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 185 aa  48.5  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00421215  hitchhiker  0.000834873 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  35.05 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 235 aa  48.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>