More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4294 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 343 aa  679    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  43.79 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  39.18 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  37.54 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  31.84 
 
 		 342 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 223 aa  119  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 248 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 229 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 249 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 259 aa  99  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 242 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 245 aa  96.3  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 248 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 249 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 238 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 252 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 247 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 241 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 235 aa  90.1  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 253 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 263 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 343 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 268 aa  89  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 250 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 271 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 218 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 268 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  31.22 
 
 		 266 aa  86.7  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  35.33 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  36.11 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 234 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1468  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  33.17 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 268 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 223 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 229 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 228 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  31.8 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 252 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  30.89 
 
 		 247 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  30.6 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 210 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 242 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 231 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  33.77 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  30.22 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 250 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  49.32 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 173 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>