More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1677 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  441  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  39.9 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  40.78 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  40.78 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  40.78 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 212 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  40.67 
 
 		 200 aa  99  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 242 aa  95.5  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  38.15 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  32.34 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 190 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  31.22 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  32.89 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 271 aa  78.2  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  29.93 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 285 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  30.57 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  46.84 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  25.94 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 230 aa  62  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 272 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  25.7 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  29.75 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  36.17 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  28.41 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  30.09 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  26.64 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>