217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1521 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  98.36 
 
 		 244 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  59.17 
 
 		 234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 210 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 225 aa  101  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 207 aa  99.4  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 224 aa  95.1  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 224 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 214 aa  89.7  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 209 aa  89  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 218 aa  85.5  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  30.45 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  31.63 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  39.35 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  31.67 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 285 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 315 aa  68.6  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 173 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  38.68 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  41.58 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  24.55 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  29.61 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  29.61 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  29.61 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  29.08 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  29.01 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  30.53 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  29.17 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  30.28 
 
 		 199 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  30.52 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>