195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4198 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  378  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2709  regulatory protein TetR  29.21 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 244 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 244 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 244 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  25.97 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  25.97 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739082 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  25.97 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  27.12 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  27.32 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  26.9 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  24.18 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 259 aa  54.7  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 250 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 174 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  25.56 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 226 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 276 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 261 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  27.68 
 
 		 239 aa  49.3  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 255 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 228 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 260 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  48.94 
 
 		 342 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0193  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  29.14 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 236 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 235 aa  48.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 250 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 246 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0174  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0172  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.194351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4185  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 263 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0062  nucleoid occlusion protein  30.38 
 
 		 232 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 278 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1551  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209171  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 253 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 250 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 248 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 261 aa  45.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 216 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 200 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 272 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 244 aa  45.4  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1631  transcriptional regulator  27.92 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0987628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 247 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 259 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>