236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2193 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  100 
 
 		 243 aa  470  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  57.02 
 
 		 239 aa  259  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  42.02 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 269 aa  141  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  43.44 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 248 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  33.47 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  41.32 
 
 		 258 aa  109  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  33.19 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 234 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 228 aa  89.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  28.63 
 
 		 272 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 234 aa  85.9  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  27.9 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5781  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  28.63 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  36.3 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  29.15 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  36.25 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  28.69 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  31.6 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  31 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  30.04 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  28.76 
 
 		 256 aa  72  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 249 aa  71.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  42.52 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 330 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  39.5 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  34.73 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  39.67 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1468  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  27.02 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  31.61 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  34.96 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  38.26 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 289 aa  62  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  26.52 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>