237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3568 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  497  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  70.16 
 
 		 262 aa  315  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  58.4 
 
 		 272 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  56.4 
 
 		 269 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 283 aa  218  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  51.43 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  45.02 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 259 aa  201  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  42.51 
 
 		 265 aa  175  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 248 aa  172  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  42.62 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  39.92 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 		 252 aa  142  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  35.45 
 
 		 342 aa  121  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  33.61 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 304 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  35.27 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 315 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 		 310 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 272 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  33 
 
 		 247 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  34.09 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  41.21 
 
 		 258 aa  99  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 252 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 293 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 249 aa  95.9  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 239 aa  95.1  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 230 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 281 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 343 aa  92.8  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 311 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  36.71 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  29.8 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  33.2 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  33.19 
 
 		 234 aa  85.9  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  33.19 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  31.6 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  32.32 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  36.77 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  27.51 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5781  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1468  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 283 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19920  transcriptional regulator, tetR family  32.45 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314765  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  25.55 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>