172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2879 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  100 
 
 		 226 aa  445  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  60.27 
 
 		 224 aa  261  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  55 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  54.95 
 
 		 221 aa  218  6e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  46.82 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3340  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2494  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000125237  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 268 aa  81.6  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  34.12 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  29.39 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  41.58 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  29.18 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  32.59 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  27.75 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19920  transcriptional regulator, tetR family  29.53 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314765  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 191 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 232 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 247 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 192 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 192 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 192 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 343 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  27.73 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 343 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  35.77 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  29.45 
 
 		 315 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  28.17 
 
 		 222 aa  48.5  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 204 aa  48.5  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 283 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  26.27 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  46.03 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  25.7 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>