217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5079 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  391  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  89.06 
 
 		 191 aa  352  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  82.35 
 
 		 212 aa  329  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  82.35 
 
 		 212 aa  329  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  82.35 
 
 		 212 aa  329  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  81.72 
 
 		 218 aa  307  6.999999999999999e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 202 aa  98.2  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  33.97 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  32.52 
 
 		 185 aa  92  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  32.52 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  31.9 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  31.9 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  31.9 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 206 aa  85.1  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  34.57 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  34.73 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19390  transcriptional regulator, tetR family  33.79 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4231  regulatory protein TetR  32.74 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  31.18 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  32.22 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  31.71 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0927  putative transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 216 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  42.25 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  31.41 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  21.91 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  27.39 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  38.53 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  28.39 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 315 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 229 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 285 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  51.6  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 278 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 261 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  23.86 
 
 		 220 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 253 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  34.44 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 240 aa  48.9  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 232 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  32.88 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 272 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  53.49 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 295 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 271 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  22.81 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  34.23 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 249 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  28.93 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  25.41 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 234 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>