87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2000 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 189 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  65.61 
 
 		 190 aa  255  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  64.71 
 
 		 190 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  66.84 
 
 		 189 aa  228  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4231  regulatory protein TetR  63.49 
 
 		 188 aa  218  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  60.85 
 
 		 205 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  55.08 
 
 		 206 aa  208  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19390  transcriptional regulator, tetR family  56.15 
 
 		 189 aa  190  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  49.08 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 202 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  35.08 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  33.12 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  33.12 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  32.5 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 185 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 182 aa  98.2  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 182 aa  98.2  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  37.27 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 191 aa  85.9  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  32.37 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0927  putative transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 285 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1176  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1100  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 224 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  26.62 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 295 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 221 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 238 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  29.61 
 
 		 222 aa  45.1  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0658  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 232 aa  45.1  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2387  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 232 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0807  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1771  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 232 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 211 aa  44.7  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 244 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3217  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000141467  hitchhiker  0.00109998 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  32.97 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  35.87 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 256 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0332  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 250 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 222 aa  42  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 324 aa  42  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 255 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 234 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 267 aa  41.6  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 185 aa  41.2  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 226 aa  41.6  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004024  transcriptional regulator  25.84 
 
 		 196 aa  41.2  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 249 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 205 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 205 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 220 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  32.29 
 
 		 205 aa  41.2  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  30.77 
 
 		 195 aa  41.2  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>