269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6632 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 205 aa  95.1  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 205 aa  95.1  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 205 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 205 aa  95.1  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 205 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 200 aa  89.4  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  39.87 
 
 		 183 aa  88.6  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  23.86 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 212 aa  85.1  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  34.27 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  36.3 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  25.14 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  21.71 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  24.86 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  25.43 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  22.78 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  22.91 
 
 		 181 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3055  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  0.155543 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  20.97 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  26.8 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  23.64 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 198 aa  62  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  25.6 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  48.28 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  27.06 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2767  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  23.53 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2811  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548519  normal  0.159647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2794  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.630327  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  45.31 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  20.45 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  47.37 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21540  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  43.55 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  27.12 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  19.19 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0421  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  17.74 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  25.22 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  22.81 
 
 		 184 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  37.29 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>