78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19390 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19390  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 189 aa  364  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  56.15 
 
 		 189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  55.32 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  52.66 
 
 		 190 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  49.47 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4231  regulatory protein TetR  54.74 
 
 		 188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  51.34 
 
 		 189 aa  157  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  50.26 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  43.96 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 202 aa  121  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  37.11 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  37.11 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  41.72 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  36.48 
 
 		 182 aa  104  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  36.48 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  36.48 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  38.89 
 
 		 183 aa  95.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  39.39 
 
 		 194 aa  92  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 192 aa  80.9  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3217  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000141467  hitchhiker  0.00109998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0927  putative transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  35.42 
 
 		 190 aa  48.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  36.84 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 258 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 256 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1203  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 283 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  32.89 
 
 		 256 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 218 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 239 aa  45.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  39.2 
 
 		 223 aa  44.7  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  32.29 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 255 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 250 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 330 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1491  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3471  hypothetical protein  38.04 
 
 		 236 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 242 aa  42  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3670  hypothetical protein  38.04 
 
 		 236 aa  42  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 259 aa  41.6  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 272 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 243 aa  41.2  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 265 aa  41.2  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  41.2  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>