206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1793 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  417  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  65.75 
 
 		 202 aa  226  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  57.8 
 
 		 197 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  53.89 
 
 		 319 aa  138  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  47.02 
 
 		 174 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 183 aa  62  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 259 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19490  transcriptional regulator, tetR family  39.24 
 
 		 168 aa  54.3  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  29.34 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  40.57 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 243 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  28.99 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  35.77 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 246 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 260 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 167 aa  48.9  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  28.03 
 
 		 242 aa  48.5  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1551  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209171  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 246 aa  46.2  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  32 
 
 		 272 aa  46.6  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  50.77 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2709  regulatory protein TetR  28.12 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 180 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  44 
 
 		 227 aa  45.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 231 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 231 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 278 aa  45.1  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 263 aa  45.1  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 238 aa  45.1  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 208 aa  45.1  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 221 aa  45.1  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>