278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0060 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  509  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  76.64 
 
 		 244 aa  388  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  54.35 
 
 		 229 aa  238  9e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  35.27 
 
 		 276 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 278 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 241 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  31.88 
 
 		 230 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 232 aa  99.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 249 aa  99  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 227 aa  98.2  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  34.76 
 
 		 230 aa  98.6  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  33.19 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 224 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  38.06 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 225 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 283 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  40.46 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  34.67 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 225 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 230 aa  89.4  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 235 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  85.1  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  31.68 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  29.81 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  30.45 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  28.24 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 295 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  29.67 
 
 		 196 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  26.61 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  26.2 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  27.57 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  27.66 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  25.12 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  25.4 
 
 		 199 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  30.39 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4581  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0138954  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 333 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 180 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 200 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 205 aa  53.9  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  26.42 
 
 		 190 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>