136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3626 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 261 aa  511  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  70.21 
 
 		 247 aa  298  6e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  52.7 
 
 		 230 aa  216  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 226 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  50.92 
 
 		 217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  50.92 
 
 		 217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  48.9 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  45.89 
 
 		 234 aa  189  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  45.42 
 
 		 246 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 217 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  47.37 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  42.27 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  43.93 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  43.69 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  41.5 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  39.09 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  41.1 
 
 		 241 aa  129  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 237 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 247 aa  99  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 254 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  40.87 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 232 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 195 aa  89  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 		 235 aa  89  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 248 aa  89  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  39.17 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 261 aa  85.9  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  32.95 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  29 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  31.34 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  41.28 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  36.28 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  31.62 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  41.28 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 257 aa  52.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 191 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 209 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 197 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0641  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 208 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 203 aa  48.9  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2709  regulatory protein TetR  33.82 
 
 		 192 aa  48.9  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3217  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000141467  hitchhiker  0.00109998 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 208 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 196 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 224 aa  46.6  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 202 aa  46.2  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 244 aa  45.8  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  34.38 
 
 		 256 aa  45.4  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 285 aa  45.4  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  46.3 
 
 		 342 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  46.43 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>