180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0550 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 283 aa  569  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  63.52 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  55.75 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  55.36 
 
 		 249 aa  244  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  57.52 
 
 		 254 aa  239  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 237 aa  125  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  36.12 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 236 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  38.12 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 254 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 216 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 261 aa  109  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  31.91 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 227 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 260 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 225 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 226 aa  105  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  33.78 
 
 		 234 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  33.2 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 236 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 221 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  29.11 
 
 		 242 aa  97.1  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 		 224 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 244 aa  95.9  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  31.49 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 225 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  32.07 
 
 		 230 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  32.76 
 
 		 241 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 247 aa  93.2  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  35.48 
 
 		 251 aa  93.2  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 235 aa  92.8  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 227 aa  89.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 248 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  32.51 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  24.89 
 
 		 227 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  26.22 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  27.32 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 203 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  26.37 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  32.31 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  27.68 
 
 		 199 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 206 aa  50.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 191 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 195 aa  49.3  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 222 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 		 197 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2388  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 206 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 183 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 212 aa  48.9  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  27.03 
 
 		 197 aa  48.9  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 212 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  27.13 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 207 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 193 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 198 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 217 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 202 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 196 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 214 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 199 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>