243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8207 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 240 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  63.79 
 
 		 249 aa  298  6e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  63.44 
 
 		 232 aa  296  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  63.52 
 
 		 283 aa  284  9e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  57.08 
 
 		 254 aa  239  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  42.15 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 278 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 254 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  40.1 
 
 		 230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 260 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  38.97 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  38.01 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  36.68 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 225 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  33.47 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  36.29 
 
 		 259 aa  105  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  33.19 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  34.8 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  33.2 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  41.53 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  33.48 
 
 		 241 aa  96.3  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 225 aa  97.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 260 aa  95.1  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 224 aa  95.1  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 242 aa  92.8  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  31.53 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 227 aa  89.4  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  33.18 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  28.8 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  29.41 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  30.77 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  37.61 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 230 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  29.39 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  35.56 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  29.13 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  23.04 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  37.17 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 183 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 197 aa  52  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  26.23 
 
 		 197 aa  52  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 191 aa  52  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  32.9 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 208 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 189 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 201 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3217  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 207 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000141467  hitchhiker  0.00109998 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  27.73 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 193 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  25 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 222 aa  48.9  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  36.51 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  27.52 
 
 		 184 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>