156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2858 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  427  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  427  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  95.83 
 
 		 217 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  64.02 
 
 		 226 aa  267  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  62.15 
 
 		 236 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  63.89 
 
 		 234 aa  257  8e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  55.77 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  50.92 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 247 aa  181  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  43.36 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  48.44 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 278 aa  147  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  41.2 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 246 aa  142  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  41.55 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  38.91 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  42.11 
 
 		 241 aa  121  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  42.78 
 
 		 276 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 225 aa  117  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  40.87 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 260 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  39.45 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 215 aa  95.1  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 283 aa  94  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 216 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 254 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 261 aa  87.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  32.84 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  29.33 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  26.46 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  27.65 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  40.17 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  28.5 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  31.68 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 230 aa  51.6  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3217  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000141467  hitchhiker  0.00109998 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  26.23 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  38.54 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  38.64 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 257 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6348  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 400 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00107036  hitchhiker  0.00103053 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 236 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 311 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  36.14 
 
 		 343 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>