183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0325 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 229 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  34.08 
 
 		 206 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  36.99 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  36.79 
 
 		 206 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  29.19 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  30.34 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  26.44 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  28.65 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 184 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 199 aa  52.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  24.22 
 
 		 202 aa  52.4  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0641  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 254 aa  52  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  24.88 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  32.35 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  26.77 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 184 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 184 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 184 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 232 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 246 aa  48.9  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 196 aa  48.5  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 204 aa  48.5  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0120  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.654836  normal  0.0157031 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 205 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 150 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 202 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>