More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0941 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  480  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3567  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.409379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3790  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 256 aa  95.1  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4005  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0027  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 191 aa  87.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  37.86 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1892  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  31.03 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  40.91 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 200 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  32.47 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 191 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 189 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 195 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  37.25 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 195 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 195 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 403 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 208 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 423 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 421 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 202 aa  49.3  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 307 aa  48.9  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  26.86 
 
 		 190 aa  48.5  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 414 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  38.46 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 324 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  32.2 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  35.25 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0114  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621262  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 202 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  35.8 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>