141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3310 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 256 aa  501  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  44.17 
 
 		 230 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4005  TetR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3790  transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  40.31 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3567  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 234 aa  112  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.409379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  37.55 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 239 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1892  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0027  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  38.73 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  37.86 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  40.4 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  35.29 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  34.65 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 203 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  30.25 
 
 		 206 aa  53.1  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 234 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 240 aa  52.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 204 aa  49.3  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 202 aa  49.3  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 203 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0120  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 193 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.654836  normal  0.0157031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 197 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2449  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  31.31 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 188 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 231 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 201 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 213 aa  46.2  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 206 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 206 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 206 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 212 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 193 aa  46.2  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 224 aa  45.4  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 197 aa  45.8  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 200 aa  45.4  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 224 aa  45.4  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 207 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 228 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  28.43 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  27.27 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  34.17 
 
 		 184 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 202 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>