More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0136 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 243 aa  460  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  51.29 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1892  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  41.91 
 
 		 249 aa  135  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  41 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  39.75 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4005  TetR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3790  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3567  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 234 aa  85.1  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.409379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0027  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  41.58 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  43 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 180 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 201 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0808  transcriptional regulator, TetR family  55.36 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  36.05 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  34.95 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  40.54 
 
 		 190 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  34.43 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 183 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  31.86 
 
 		 201 aa  52.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 222 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  41.57 
 
 		 201 aa  52.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 197 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 198 aa  52  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 204 aa  52  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 209 aa  52  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 196 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 203 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 332 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  34.21 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  27.88 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>