More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1473 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
207 aa  410  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  43.3 
 
 
207 aa  141  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
248 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 
219 aa  88.2  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
223 aa  86.3  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
207 aa  84.7  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 
307 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  30.3 
 
 
206 aa  79  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0734  putative transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522503  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0676  putative transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  24.75 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  33.92 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1609  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  26.95 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  30.22 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 
195 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1203  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 
229 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 
208 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
232 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
206 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
235 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  29.81 
 
 
206 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 
196 aa  61.6  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 
229 aa  61.6  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
201 aa  61.6  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
209 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 
222 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 
209 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  29.07 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 
186 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  26.25 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  28.91 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
231 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 
222 aa  59.3  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
212 aa  58.9  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 
232 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 
247 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 
220 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  24.1 
 
 
200 aa  58.5  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  29.7 
 
 
220 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1344  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
213 aa  58.2  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 
214 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 
209 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
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NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
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NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 
217 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 
196 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 
220 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
216 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
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NC_010571  Oter_0510  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
222 aa  57.4  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.673095  normal 
 
 
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