More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3567 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 214 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  34.34 
 
 		 202 aa  115  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 221 aa  91.7  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  44.2 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 233 aa  85.9  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  37.2 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  31.12 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  45.53 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4118  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4277  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  49.28 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  42.06 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16540  transcriptional regulator, tetR family  29.86 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1396  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 424 aa  52.4  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  36.14 
 
 		 246 aa  52.4  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 271 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 258 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 243 aa  48.9  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  30.41 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  56.52 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 244 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3831  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.484216  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  45.61 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>