180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4070 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  90.35 
 
 		 228 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  74.3 
 
 		 212 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  78.16 
 
 		 220 aa  321  7e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  72.46 
 
 		 218 aa  308  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1396  TetR family transcriptional regulator  57.07 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  51.22 
 
 		 230 aa  194  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  43.56 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  38.53 
 
 		 232 aa  141  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16540  transcriptional regulator, tetR family  37.95 
 
 		 219 aa  139  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 252 aa  132  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 211 aa  111  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  42.11 
 
 		 205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 214 aa  85.9  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  43.09 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  38.58 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  44.05 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4118  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1062  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0959794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  34.13 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  34.13 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  46.55 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 190 aa  49.3  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 283 aa  48.5  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  32.03 
 
 		 235 aa  48.5  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 277 aa  48.5  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 208 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 278 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 278 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 278 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  27.5 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  32.54 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2556  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 200 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00763  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.827218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2846  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00780  hypothetical protein  41.18 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.978873  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  40.98 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0944  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  28.02 
 
 		 346 aa  46.2  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  43.1 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0850  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0861  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2847  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0304787 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 250 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 238 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1038  regulatory protein, TetR  38.98 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0256263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 235 aa  45.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 206 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 195 aa  45.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 249 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 233 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 203 aa  45.4  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 191 aa  45.1  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3846  regulatory protein TetR  37.35 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>