More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0748 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  391  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  44.92 
 
 		 200 aa  151  7e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  44.39 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 233 aa  128  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  41.14 
 
 		 225 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  40.49 
 
 		 269 aa  112  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 298 aa  99.8  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 207 aa  88.2  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0499  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1196  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 228 aa  85.1  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000002147  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 209 aa  84.3  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3888  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 349 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  28.48 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  27.33 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  30.72 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  23.61 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5732  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5353  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  22.01 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5442  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 231 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  27.33 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 165 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  24.8 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  26.04 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 269 aa  48.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 192 aa  48.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  33.77 
 
 		 238 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  24.36 
 
 		 229 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  35.8 
 
 		 238 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 212 aa  47.8  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 193 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 238 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 273 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 276 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 272 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 273 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 272 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 273 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 273 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  34.07 
 
 		 340 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  23.57 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 318 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  22.81 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  20.35 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  20.93 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  24.5 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 317 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 251 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 291 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 316 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 316 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  31.82 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4065  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>