More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000229 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  509  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  78.1 
 
 		 241 aa  404  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  47.23 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 239 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  33.99 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  33.88 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2483  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0489732  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  46.43 
 
 		 346 aa  54.7  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 372 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  44.07 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  29.52 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 191 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 226 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  37.31 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4057  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.1 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 205 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 200 aa  52.8  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.1 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 191 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  38.75 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 183 aa  52.4  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 193 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  28.43 
 
 		 220 aa  52.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 196 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 225 aa  52  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 199 aa  52  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  22.46 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  31.96 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  43.64 
 
 		 340 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 318 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 204 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 317 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 316 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 318 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>