More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2358 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 216 aa  436  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 224 aa  141  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  34.52 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  36.22 
 
 		 197 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 208 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 197 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 197 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  33.87 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  32.63 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  29.7 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 400 aa  62.4  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 228 aa  62  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  30.34 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  32.43 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0503  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  30.19 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0503  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  29.29 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2587  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 434 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4158  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 445 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2548  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 482 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2593  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 482 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0455  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0937341  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>