More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0905 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5181  TetR family transcriptional regulator  52.23 
 
 		 190 aa  148  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0290  TetR family transcriptional regulator  50.9 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4581  transcriptional regulator, TetR family  45.29 
 
 		 186 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.133815 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2449  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 196 aa  99.4  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 203 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3503  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 200 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1448  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0355171  normal  0.193745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 211 aa  62  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  27.32 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  38.57 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  36 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 207 aa  52.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 176 aa  52.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 200 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 200 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 206 aa  52  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  36.11 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5853  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161572 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0706  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3913  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20842  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  41.38 
 
 		 204 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3163  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  40.85 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4199  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680761 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 212 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 222 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 		 223 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  50.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 236 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  46 
 
 		 200 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  36.51 
 
 		 207 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 217 aa  49.3  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 203 aa  49.3  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  36.51 
 
 		 205 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 218 aa  48.9  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 195 aa  48.9  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 239 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 221 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 233 aa  48.9  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 230 aa  48.9  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 202 aa  48.9  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 196 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 210 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 195 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 225 aa  48.9  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 205 aa  48.5  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>