162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3613 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 221 aa  448  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  71.36 
 
 		 206 aa  290  9e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  70.85 
 
 		 206 aa  275  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  64.82 
 
 		 212 aa  265  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  58.08 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  45.03 
 
 		 232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  42.36 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  38.79 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 193 aa  95.5  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  32.93 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  30.88 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  33.76 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  30.94 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 192 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  31.94 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  30.99 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 167 aa  53.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 307 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 333 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 230 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 181 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3790  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10300  transcriptional regulator, tetR family  27.16 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  30.4 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  26.09 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 175 aa  49.3  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  33.77 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  27.21 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 186 aa  47  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>