219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4081 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  400  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 193 aa  151  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  49.7 
 
 		 181 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 184 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 184 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 184 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  45.88 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  43.53 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 222 aa  91.7  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  41.92 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  40.8 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 203 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 240 aa  88.6  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  38.01 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 200 aa  85.1  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 204 aa  84.7  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  31.98 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  33.53 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 239 aa  78.2  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 236 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
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NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
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NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  32.11 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  36.42 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  33.53 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  30.11 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  36.87 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  33.14 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  42.48 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  30.22 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1537  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313453  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  32.97 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
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NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  36.09 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  28.75 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
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