160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4167 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 244 aa  481  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  78.24 
 
 		 236 aa  364  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1537  TetR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313453  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  42.6 
 
 		 222 aa  108  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 206 aa  95.1  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 206 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 193 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 186 aa  89.4  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  32.98 
 
 		 201 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 184 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  37.36 
 
 		 190 aa  85.9  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 184 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 184 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  45.05 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  39.81 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  49.07 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  43.93 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  39.2 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
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NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
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NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  36.87 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 202 aa  65.1  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 196 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 199 aa  62  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  30.5 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  31.5 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  37.84 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  37.86 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1710  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  25.82 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 150 aa  52.4  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4924  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0122195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 207 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 199 aa  50.4  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 206 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_1501  regulatory protein TetR  30.12 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856799  normal  0.774912 
 
 
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NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  35.35 
 
 		 228 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
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NC_012791  Vapar_4409  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 225 aa  48.9  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 196 aa  48.9  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
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NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 208 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
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NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
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