More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4154 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



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PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  94.02 
 
 		 235 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  89.7 
 
 		 234 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  82.76 
 
 		 236 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  82.76 
 
 		 237 aa  359  2e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  85.58 
 
 		 236 aa  352  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  78.99 
 
 		 239 aa  336  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  62.68 
 
 		 211 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
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NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  52.74 
 
 		 205 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  52.74 
 
 		 205 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
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NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  53.47 
 
 		 205 aa  202  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 203 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 205 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  44.33 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  45.77 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
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NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  45.41 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  45.27 
 
 		 208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 216 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 222 aa  108  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  40.46 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  38.12 
 
 		 206 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 184 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 184 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 203 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
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NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 184 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 181 aa  91.7  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  35.6 
 
 		 190 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 186 aa  89  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 204 aa  88.6  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 192 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 200 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  37.79 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
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NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
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NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  42.73 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
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NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  31.18 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  42.15 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  51.39 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 191 aa  74.7  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  41.94 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  28.89 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4026  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62673  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  41.28 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00920  transcriptional regulator, tetR family  36.84 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0641  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1066  transcriptional regulator, TetR family  64 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.52451  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  27.81 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
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NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
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NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
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NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
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NC_012791  Vapar_4409  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
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NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
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NC_010511  M446_2111  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 188 aa  62  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.0160657 
 
 
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NC_010571  Oter_0510  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.673095  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
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NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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