More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0510 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0510  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  458  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.673095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 213 aa  102  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  24.3 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  23.29 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  46.55 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  44.07 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2636  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4517  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000667757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  45.16 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1448  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0355171  normal  0.193745 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  23.63 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  29.41 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  26.63 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  23.08 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 288 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  27.12 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  27.59 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 253 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 207 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  23.43 
 
 		 251 aa  52.8  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>