More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5606 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 189 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4924  TetR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0122195 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  33.95 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  41.14 
 
 		 207 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 216 aa  85.1  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 240 aa  81.3  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  35.44 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  34.34 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 204 aa  74.3  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 239 aa  72  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  71.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 207 aa  70.9  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  37.74 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  30.67 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  32.92 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  25.15 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  32.95 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
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NC_008686  Pden_0668  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109249  normal  0.847152 
 
 
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NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  30.81 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
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NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
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NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
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NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  24.22 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  27.98 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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