More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1098 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  100 
 
 		 206 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  94.66 
 
 		 206 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  82.21 
 
 		 207 aa  299  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 186 aa  135  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  48.8 
 
 		 191 aa  124  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  48.28 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  41.95 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  43.03 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 196 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 236 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  42.23 
 
 		 195 aa  98.2  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 203 aa  98.2  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  36.41 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  42.44 
 
 		 191 aa  95.9  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 236 aa  95.5  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 237 aa  94.7  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  41.75 
 
 		 188 aa  94.7  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
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NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  34.41 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 217 aa  92  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  41.01 
 
 		 212 aa  91.7  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 184 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 193 aa  89  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 234 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4026  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62673  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 218 aa  85.9  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 150 aa  86.3  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 194 aa  85.1  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 211 aa  84.7  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  42.01 
 
 		 181 aa  84.7  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  35.85 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2111  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.0160657 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  46.49 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4769  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  33.16 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  39.49 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03880  putative transcription regulator protein  35.42 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  38.18 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
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NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
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NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_4409  transcriptional regulator, TetR family  35.41 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
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NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  34.43 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
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NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  63.93 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
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NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010678  Rpic_4571  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281671  normal  0.592331 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_3499  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553383  normal  0.3226 
 
 
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NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  43.69 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
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NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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