More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3579 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  394  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  45.88 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  44.97 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 203 aa  114  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  44.79 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  40.31 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 222 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 203 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 222 aa  99  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  37.08 
 
 		 224 aa  94.7  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 181 aa  92.8  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 236 aa  92.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 211 aa  91.3  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  33.16 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  38.59 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 205 aa  84.7  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  37.95 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  41.28 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  31.82 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  31.02 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  39.7 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  38.07 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  36.26 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  36.52 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  44.04 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4026  TetR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62673  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 236 aa  72  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  34.09 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  31.09 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4409  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3499  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553383  normal  0.3226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4769  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4571  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281671  normal  0.592331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_003296  RS03880  putative transcription regulator protein  33.66 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>