158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4916 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  423  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  58.79 
 
 
206 aa  224  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  58.08 
 
 
221 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  55.87 
 
 
212 aa  215  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  59.8 
 
 
206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  42.38 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  41.06 
 
 
243 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 
217 aa  111  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 
232 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  37.02 
 
 
197 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
230 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
231 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  42.2 
 
 
193 aa  85.5  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  37.14 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  33.73 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  35.23 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
248 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 
203 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
195 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
195 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  35.36 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
203 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
216 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
219 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 
208 aa  58.5  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
195 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 
214 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  30.97 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
202 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  29.61 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  32.9 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
207 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 
213 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
234 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
184 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 
189 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 
183 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 
202 aa  55.5  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 
249 aa  55.5  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
239 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 
195 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 
209 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  40.4 
 
 
256 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
192 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
211 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 
196 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  26.49 
 
 
201 aa  52.8  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 
208 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 
333 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  41.58 
 
 
222 aa  52.4  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 
204 aa  52  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
167 aa  51.2  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  31.52 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
186 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
216 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
231 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
224 aa  49.3  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
192 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
208 aa  49.3  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
240 aa  48.9  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
196 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
196 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
225 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal 
 
 
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