185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10720 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  491  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  40.34 
 
 		 259 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  30.71 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 283 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 232 aa  95.1  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 254 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  29.39 
 
 		 216 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 221 aa  89.4  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 240 aa  89  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  29.18 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  31.49 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  30.45 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  30.09 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 470 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  31.25 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 217 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  27.61 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 180 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  34.15 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  35 
 
 		 184 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  31.48 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  27.18 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 193 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 189 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 199 aa  46.6  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 212 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 398 aa  46.2  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 204 aa  46.2  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 200 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 251 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 218 aa  45.4  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  23.93 
 
 		 227 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 203 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 477 aa  45.4  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 477 aa  45.4  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1711  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  45.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.678609 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4031  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.5 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>