More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0533 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 398 aa  813    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 212 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 212 aa  93.6  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 209 aa  89.7  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 195 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 202 aa  75.1  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 195 aa  68.9  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 211 aa  68.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  23.05 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  53.97 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  54.1 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 211 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 203 aa  57  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 192 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2587  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  30.51 
 
 		 204 aa  57  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2548  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 482 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2593  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 482 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 216 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 191 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 194 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 213 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 191 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 195 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 190 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  31.25 
 
 		 278 aa  53.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 237 aa  53.1  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  40 
 
 		 212 aa  53.5  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 213 aa  53.1  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 220 aa  53.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  38.03 
 
 		 225 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 205 aa  53.1  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 242 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 192 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 192 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 192 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 191 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 248 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 192 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 224 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 228 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  23.88 
 
 		 190 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 226 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  23.32 
 
 		 198 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 191 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  21.29 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 242 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 203 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 215 aa  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 214 aa  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 205 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 226 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 289 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 291 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 193 aa  51.2  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 201 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 220 aa  50.8  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 205 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 234 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 185 aa  50.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 234 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 206 aa  50.4  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 206 aa  50.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4158  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 445 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 216 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 335 aa  50.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 288 aa  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 205 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 207 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 203 aa  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 213 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 195 aa  50.1  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 195 aa  49.7  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 217 aa  49.7  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>