More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0314 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  398  9.999999999999999e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 209 aa  121  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 202 aa  114  8.999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0583  regulatory protein, TetR  27.69 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 398 aa  68.9  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  23.6 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  25.52 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1910  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0010144  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  42.42 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  41.54 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  42.42 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 332 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  32.84 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  22.35 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 244 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 243 aa  52.8  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 238 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>