More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3161 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  391  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2712  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  54.35 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  40.58 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  46.55 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0304  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 333 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  36.49 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 497 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40380  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 307 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 288 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 247 aa  53.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 286 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 269 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 247 aa  53.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 233 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 248 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  41.67 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2686  regulatory protein TetR  27.4 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3426  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 226 aa  51.6  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  35.71 
 
 		 237 aa  51.6  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 217 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  26.44 
 
 		 222 aa  51.2  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  33.06 
 
 		 223 aa  51.2  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 232 aa  51.2  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>