More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05640 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  457  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24360  transcriptional regulator  38.73 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 199 aa  91.3  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0384  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  32.59 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  30.63 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  42.11 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  35.37 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 261 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 256 aa  52.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  39.68 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 200 aa  52.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 257 aa  52.4  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 192 aa  52.4  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 266 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  27.33 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  27.63 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  42.62 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  42.62 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 291 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  42.62 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  42.62 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  42.62 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>