More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0760 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 199 aa  131  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  41.85 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 201 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 201 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 201 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 211 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 227 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 201 aa  121  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  36.92 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 260 aa  120  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 219 aa  114  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3531  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1978  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2579  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0006  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0589242  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3117  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100627  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3781  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0013  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3842  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3103  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.454868  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3375  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 206 aa  111  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 212 aa  111  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  36.27 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 198 aa  95.5  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  30.05 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 287 aa  71.6  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  25.77 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  25.77 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  29.12 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
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NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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