More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0746 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
190 aa  380  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  96.32 
 
 
191 aa  367  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  95.79 
 
 
191 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  95.79 
 
 
192 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  95.26 
 
 
192 aa  364  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  95.79 
 
 
191 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  95.79 
 
 
192 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  94.74 
 
 
192 aa  362  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  94.74 
 
 
192 aa  361  3e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  94.74 
 
 
191 aa  359  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 
196 aa  72  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
215 aa  61.6  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 
195 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  39.47 
 
 
204 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 
236 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
202 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 
310 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 
195 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  38.81 
 
 
204 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  28.57 
 
 
222 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
222 aa  55.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
214 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  40 
 
 
223 aa  55.5  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  23.68 
 
 
251 aa  55.5  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  23.03 
 
 
217 aa  55.1  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
201 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  21.18 
 
 
193 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
204 aa  54.7  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  21.33 
 
 
211 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  23.48 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
198 aa  53.9  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
222 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 
190 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4973  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 
201 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0231413  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
236 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 
222 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
196 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
196 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
195 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
196 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
196 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
398 aa  53.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 
242 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
196 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 
186 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 
196 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  25.81 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  22.5 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  27.66 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  26.74 
 
 
221 aa  53.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 
211 aa  53.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
218 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 
191 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
192 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3386  TetR family transcriptional regulator  21.71 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 
224 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 
201 aa  52.4  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1774  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 
200 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 
207 aa  52.4  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 
203 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 
224 aa  52  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 
215 aa  52  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0547  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 
198 aa  52  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
211 aa  52  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 
197 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 
211 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 
181 aa  51.6  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 
215 aa  52  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  45.28 
 
 
216 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 
201 aa  51.6  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 
188 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 
188 aa  51.6  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 
188 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 
188 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 
188 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  26.03 
 
 
230 aa  51.2  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 
207 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
222 aa  51.2  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
288 aa  51.2  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
189 aa  51.2  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>