More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1776 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 213 aa  111  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0611  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10053  putative TetR transcriptional regulator  27.08 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  27.42 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2516  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  26.17 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0215  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2174  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1265  TetR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4607  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4592  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4382  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4223  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4721  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0628  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4577  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4626  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  24.05 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3326  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  42.03 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3324  transcriptional regulator, TetR family  21.2 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  26.55 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 299 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  30.34 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3108  TetR family transcriptional regulator  21.2 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3354  TetR family transcriptional regulator  21.2 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  48.15 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 271 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
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NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
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NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
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