47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS4382 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS4382  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
212 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4577  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
212 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4721  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
212 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4592  TetR family transcriptional regulator  98.58 
 
 
212 aa  427  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4223  TetR family transcriptional regulator  98.11 
 
 
212 aa  425  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0628  transcriptional regulator, TetR family  98.58 
 
 
212 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447139  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4607  transcriptional regulator, TetR family  98.11 
 
 
212 aa  425  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4626  transcriptional regulator, TetR family  98.11 
 
 
212 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 
192 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 
196 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3313  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.212765  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 
206 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3326  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 
185 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  27.43 
 
 
191 aa  45.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3354  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
185 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3108  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
185 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3324  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 
185 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 
195 aa  45.1  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  25.26 
 
 
232 aa  45.1  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
196 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  30 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3094  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
185 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.432559  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
224 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2177  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 
193 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.191251  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  22.83 
 
 
195 aa  42.4  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
209 aa  42.4  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 
185 aa  42  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
223 aa  42.4  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
199 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
222 aa  42.4  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
204 aa  42  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  22.54 
 
 
193 aa  41.6  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 
185 aa  41.6  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
231 aa  41.6  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>